Shiatsu wykonuje się na macie, na podłodze. Masowany pozostaje w pozycji leżącej (na brzuchu, plecha, na boku). Może być także wykonywane w pozycji siedzącej – w tym na krześle do masażu, w zależności od potrzeb i kondycji masowanego.
W trakcie masażu osoba masowana przez cały czas pozostaje w pełni ubrana, stąd zaleca się przygotować sobie wygodne, niekrępuące ruchów odzienie z naturalnych materiałów.